BioLINCC在心血管疾病研究领域中的应用

发布日期:2020-02-20 03:05 来源:网络整理 浏览量:
  • 第一节:开放数据库BioLINCC的使用

    第二节:BioLINCC在心血管疾病研究领域案例分析

    第一节 开放数据库BioLINCC的使用

    1. BioLINCC数据库

    BioLINCC,即生物标本和数据采集信息中心(Biologic Specimen and Data Repositories Information CoordinatingCenter),是2008年由NHLBI建立的数据库,旨在帮助科研人员更便捷地获取研究数据,同时提高NHLBI资助项目的转化率。BioLINCC数据库包含两类数据,一是NHBLI生物标本数据,这类数据自1975年开始由血液疾病部门(Division of Blood resources)管理,一类是NHBLI数据,这类数据自2000年开始由心血管科学研究中心(Division of CardiovascularSciences)管理。图1概述了BioLINCC的组织流程。

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    图1. BiLINCC组织流程

    NHBLI生物标本数据库负责获取、储存生物标本,同时将质量合格的生物样本分配给科研人员。早期BioLINCC生物数据库的标本主要包括血浆、血清以及全血,这些标本来源于研究供血和受血患者的几项临床研究。近几年,生物数据库还包含了来源于心血管、肺部疾病以及血液系统疾病研究的标本。

    NHBLI临床研究数据主要来源于最近70多年以来的流行病学研究和临床研究,包含来自于145家中心临床注册研究和观察性研究的数十万患者数据。来源于临床注册研究的数据包含患者基线资料、中期随访信息、辅助研究以及预后资料(包含实验室检查)。流行病学研究数据包含在整个观察周期内获得的所有监测结果。其中部分数据集未必包含原始数据(比如心电图各导联信息、食物热量数据),这些原始数据将被整理成一些汇总数据或指标。研究人员或NHBLI认为无效的数据不能被提交至数据库。

    1 BioLINCC官网:结构和功能

    BioLINCC网址为:https://biolincc.nhlbi.nih.gov/。这一网址包含面向全部用户的公共信息和面向注册用户的个人空间。BioLINCC提供了NHLBI临床注册研究和流行病学研究的大量信息,既包含研究总结、参考文献和研究方案,也包含相关研究的深度信息,包括相关研究的延伸信息、BioLINCC模板以及利用该研究数据发表的文献集合。用户如申请相关数据,应成为注册用户。BioLINCC网站导航栏包括生物标本和数据资源(Biospecimen andData resources),使用手册和表格(Proceduresand Forms),新建或提交数据库(Build/submitNew Collection)(图2)。

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    图2. BioLINCC官网主页

    其中,【生物标本和数据资源】工具栏包含概论(overview),BioLINCC数据来源的研究(studies),教学数据集(Teaching datasets),已申请数据再次使用申请说明(renew Existing Data UseAgreement),BioLINCC数据库相关文献(Publication),NIH资助机会(Funding Opportunities)、非BioLINCC资源(Non-BioLINCC Resources)。其中教学数据集是指无需付费即可免费使用的数据资源(需注册),包括Framingham Heart Study,DigitalisInvestigation Group (DIG),Childhood Asthma ManagementProgram (CAMP)这三项研究的数据。已申请数据再次使用申请说明,是指BioLINCC数据申请之后3年内失效,无法再次直接使用,申请者如需再次使用,应重新提交使用申请。【使用手册和表格】工具栏包含BioLINCC使用手册(BioLINCC Handbook)、数据使用申请表格(Forms)、批准使用同意书(Aggreement Templates)(图3)。

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    图3. BioLINCC工具栏

    2 BioLINCC数据申请

    申请BioLINCC数据需首先注册BioLINCC网站。如已经明确需使用哪一研究的数据库,可直接在首页输入研究名称进行检索(图4),检索页面可出现很多研究列表(图5),点击进入目标研究页面,可以看到目标研究的基本信息,包括研究类型、研究起止时间、更新时间、数据使用开放与禁忌、研究摘要等。

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    图4. 在首页检索目标研究

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    图5. 目标研究主页面

    目标研究页面上方右侧或页面最下端,点击Request Specimens and/orData,即可开始申请BioLINCC数据(图6)。

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    图6. 申请BioLINCC数据按钮

    申请使用的数据种类分为生物标本数据、研究数据、生物标本和相关研究数据,根据数据种类不同,所提交的申请资料也有不同,见表1。

    表3.1不同数据类型提交的申请资料

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